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환경독성보건학회의
관련기관행사를 알려드립니다.
화합물 검색을 위한 ChemDB사이트 새롭게 단장했습니다.
작성자
koseht
작성일
2006-04-25 00:00
조회
8358
안녕하세요..
분자설계연구소입니다.
2006년 4월 14일부로 기존의 web기반 chemical database가 새 단장을 하여 open 되었습니다.
Web-based chemical database in Korea
기존 시스템 형태가 크게 개선되었으며, 그 내용을 열거하면 다음과 같습니다.
--------------------------------------------
1. 통합되어 있던 data를 5가지의 DB로 구분하였습니다.
1.1. National Cancer Institute의 공개 DB : 240,000만 건
1.2. US pharmacophia dictionary의 Drug DB : 5,000건
1.3. Physicochemical Property DB : 41,000건
1.4. 상업적으로 이용되는 chemical library : 1,500,000건
1.5. 반응에 사용되는 Building block : 250,000건
2. 개선된 substructure 검색엔진
2.1. 평균적으로 5배 가량 속도가 개선되었습니다.
3. Pharmacophore 검색엔진
3.1. 약효부위에 중요한 상호작용을 하는 작용기 구조를 통해 3차원구조 검색하는 기능을 추가하였습니다.
3.2. 이들에 대하여 volume, surface, moment of inertia, dipole moment등으로 filter하는 기능 도입.
4. 각 DB특성에 맞는 검색 사항 추가
4.1. Drug : drug의 activity class에 의한 검색 추가
4.2. Available chemicals, building block에서 supplier에 따른 검색추가
4.3. Building block에 대하여 reaction을 위한 functional group 검색추가
5. 2D 분자구조를 그릴 수 있는 activex프로그램 도입
5.1. 2D구조를 drawer할 수 있는 DBdrawX도입
5.2. template 이용하여 화학구조를 그릴 수 있도록 함
5.3. MDL mol파일형태의 화학구조를 읽고 저장이 가능함
6. 3D Pharmacophore검색을 위한 activex프로그램을 도입
6.1. chemical feature을 나타내는 hydrophobic, aliphatic, donor, acceptor등을 assign하도록 구현함.
6.2. feature과 3D구조를 alignment하여 보여줌.
7. 화합물 판매회사에 대한 정보제공
7.1. 판매회사 및 catalog number 제공
7.2. 메일로 주문할 수 있도록 form제공
8. 결과데이터를 download
8.1. 유료회원의 경우, 검색된 결과 데이터를 구조를 포함하는 sd 파일로 저장 가능
8.2. 저장될 항목들을 선택하여 저장이 가능함
9. 31개의 국외 DB link부분
9.1. 통합정보 4곳 (Chemfinder, ChemIDplus, PubChem)
9.2. 분광학정보 3곳 (ChemExper, Nist webbook, NMRshiftDB)
9.3. biological activity정보 2곳 (DTP, NIAID)
9.4. Drug information (MESH)
9.5. 문헌정보 (PubMed)
9.6. 독성 및 위해성 정보 (EPA, NTP, Scorecard, TERA)
9.7. 통합 독성 network ( Toxnet)
9.8. 환경관련 정보 (SPECTRUM Lab. Inc., SRC biodeg and chemfate)
9.9. 화합물 등록관련 정보 (EINECS, EPA CRS)
---------------------------------------------------------------------------
유료서비스 : Available Chemicals, Building block DB 및 download
년간 10만원
2006년 7월에 요금 인상이 예정되어 있습니다.
무료서비스 : 그외 NCI, Drug, PhysChem DB
__________________________________________________________________
아무쪼록 많은 사용을 부탁드리며,
사용후 불편한 점은 ChemDB사이트의 게시판에 남겨주시길 바랍니다.
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본 시스템은 (사)분자설계연구소와 (주)이큐스팜 그리고 한국과학기술정보연구원에서 진행한 지식정보관리사업의 결과입니다.
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1. 통합되어 있던 data를 5가지의 DB로 구분하였습니다.
1.1. National Cancer Institute의 공개 DB : 240,000만 건
1.2. US pharmacophia dictionary의 Drug DB : 5,000건
1.3. Physicochemical Property DB : 41,000건
1.4. 상업적으로 이용되는 chemical library : 1,500,000건
1.5. 반응에 사용되는 Building block : 250,000건
2. 개선된 substructure 검색엔진
2.1. 평균적으로 5배 가량 속도가 개선되었습니다.
3. Pharmacophore 검색엔진
3.1. 약효부위에 중요한 상호작용을 하는 작용기 구조를 통해 3차원구조 검색하는 기능을 추가하였습니다.
3.2. 이들에 대하여 volume, surface, moment of inertia, dipole moment등으로 filter하는 기능 도입.
4. 각 DB특성에 맞는 검색 사항 추가
4.1. Drug : drug의 activity class에 의한 검색 추가
4.2. Available chemicals, building block에서 supplier에 따른 검색추가
4.3. Building block에 대하여 reaction을 위한 functional group 검색추가
5. 2D 분자구조를 그릴 수 있는 activex프로그램 도입
5.1. 2D구조를 drawer할 수 있는 DBdrawX도입
5.2. template 이용하여 화학구조를 그릴 수 있도록 함
5.3. MDL mol파일형태의 화학구조를 읽고 저장이 가능함
6. 3D Pharmacophore검색을 위한 activex프로그램을 도입
6.1. chemical feature을 나타내는 hydrophobic, aliphatic, donor, acceptor등을 assign하도록 구현함.
6.2. feature과 3D구조를 alignment하여 보여줌.
7. 화합물 판매회사에 대한 정보제공
7.1. 판매회사 및 catalog number 제공
7.2. 메일로 주문할 수 있도록 form제공
8. 결과데이터를 download
8.1. 유료회원의 경우, 검색된 결과 데이터를 구조를 포함하는 sd 파일로 저장 가능
8.2. 저장될 항목들을 선택하여 저장이 가능함
9. 31개의 국외 DB link부분
9.1. 통합정보 4곳 (Chemfinder, ChemIDplus, PubChem)
9.2. 분광학정보 3곳 (ChemExper, Nist webbook, NMRshiftDB)
9.3. biological activity정보 2곳 (DTP, NIAID)
9.4. Drug information (MESH)
9.5. 문헌정보 (PubMed)
9.6. 독성 및 위해성 정보 (EPA, NTP, Scorecard, TERA)
9.7. 통합 독성 network ( Toxnet)
9.8. 환경관련 정보 (SPECTRUM Lab. Inc., SRC biodeg and chemfate)
9.9. 화합물 등록관련 정보 (EINECS, EPA CRS)
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유료서비스 : Available Chemicals, Building block DB 및 download
년간 10만원
2006년 7월에 요금 인상이 예정되어 있습니다.
무료서비스 : 그외 NCI, Drug, PhysChem DB
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아무쪼록 많은 사용을 부탁드리며,
사용후 불편한 점은 ChemDB사이트의 게시판에 남겨주시길 바랍니다.
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본 시스템은 (사)분자설계연구소와 (주)이큐스팜 그리고 한국과학기술정보연구원에서 진행한 지식정보관리사업의 결과입니다.
감사합니다.